Тъй като дори най-модерните антибиотици са безсилни срещу вирусите, те не могат да се преборят с много остри заболявания. При инфекции на дихателните пътища като хрема, възпаление на гърлото, бронхит почти винаги са виновни вирусите. Съставките на чесъна убиват освен бактериите и другите болестни причинители като вируси, гъбички, ларви или едноклетъчни (протозои). Затова и много болести — от баналната хрема през стомашно-чревните оплаквания и инфекциите на пикочните пътища до вирусния енцефалит, херпеса и епидемиите като холера и тиф — реагират много добре на лечението с чесън.
Китайски експерти твърдят, че чесънът е ефективен и срещу вирусния грип (инфлуенца). При което под вирусен грип не бива да се разбират безобидните настинки с температура, проявяващи се с кашлица, хрема и понякога със стомашно-чревни оплаквания. Истинският вирусен грип е епидемия, която се разпространява много бързо. Той може да причини тежки увреждания, особено при хора с отслабена имунна система.